تضم مختبرات العلوم الكيميائية أربع مختبرات للفحوصات المخبرية المتعلقة بالعلوم الكيميائية المتخصصة وهي مختبرات الكيمياء الصناعية، مختبرات الكيمياء الالية، مختبرات البيئة والمياه والغذاء ومختبرات متبقيات المبيدات وتقوم هذه.
الأقسام بالتعاون مع مختبرات العلوم الهندسية في قطاع مختبرات الفحص المركزي والمواصفات في الجمعية بتقديم الخدمات المتعلقة بالفحوصات المخبرية للقطاعين العام والخاص مثل فحوصات الاغذية والمياه ومواد التجميل والسجائر والمطهرات والغازات والنسيج والتطبيقات الاشعاعية، والمشتقات النفطية والعناصر الثقيلة وتقدم كذلك خدمات الفحص لكل من المؤسسات المحلية العامة على سبيل المثال لا الحصر (المؤسسة العامة للغذاء والدواء، وزارة الصناعة والتجارة، مؤسسة المواصفات والمقاييس الاردنية، وزارة البيئة، وزارة الزراعة، وزارة الصحة) وللجهات الخاصة ايضاً.